Team Rynkebyn toiminnasta vastaa Team Rynkeby -säätiö, joka on järjestäytynyt seuraavasti.
Team Rynkeby Säätiön hallituksessa on seitsemän jäsentä: Mark Hemmingsen (hallituksen puheenjohtaja), Toimitusjohtaja Rynkeby Foods, Peter Frank Andersen (varapuheenjohtaja), Magnus Berndtsson, Toimitusjohtaja Eckes-Granini Ruotsi, Torsten Fröhlich, Johtaja Taloushallinto Eckes-Granini Group GmbH, Juha Helokoski, Toimitusjohtaja Eckes-Granini Suomi, Morten Nielsen, Commercial Director Retail Rynkeby Foods ja Heidi Frederikke Sigdal, Journalist.
LUE LISÄÄ: Lataa Team Rynkeby -säätiön säännöt
Team Rynkebytä johtaa Team Rynkeby -säätiön toimitusjohtaja yhdessä kunkin osallistujamaan maajohtajan kanssa. Maajohtaja tukee oman maansa joukkueiden toimintaa tiiviissä yhteistyössä niiden ohjausryhmien ja osallistujien kanssa.
Lisäksi Team Rynkeby -säätiössä on talousjohtaja, joka on vastuussa koko projektin talousasioista, sekä talousassistentti, joka vastaa sponsoreiden laskuttamisesta sekä muista hallinnollisista tehtävistä, muun muassa IT-tuen tarjoamisesta osallistujille.
Kutakin joukkuetta johtaa kapteeni yhdessä ohjausryhmän kanssa, johon kuuluu joukko erilaisia taitoja omaavia osallistujia. Lisäksi jokaisessa joukkueessa on avainhenkilöitä, jotka vastaavat muun muassa taloudesta, sponsoreista, PR:stä ja huollosta. Nämä henkilöt voivat muodostaa joukkueen ohjausryhmän, mutta se ei ole välttämätöntä.